Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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ERCC8Q13216 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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ERCC8Q13216 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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ERCC8Q13216 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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ERCC8Q13216 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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ERCC8Q13216 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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ERCC8Q13216 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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ERCC8Q13216 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERCC8Q13216 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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