Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BPTFQ12830 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.8 ms