Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ9

KRTAP4-8, Keratin-associated protein 4-8, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-8Q9BYQ9 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms