Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWL3

C1orf43, Uncharacterized protein C1orf43, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43Q9BWL3 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
C1orf43Q9BWL3 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms