Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms