Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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