Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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PTPRNQ16849 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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PTPRNQ16849 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
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PTPRNQ16849 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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PTPRNQ16849 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRNQ16849 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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