Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPN21Q16825 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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