Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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RPE65Q16518 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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RPE65Q16518 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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RPE65Q16518 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
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