Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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SNCBQ16143 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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SNCBQ16143 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
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SNCBQ16143 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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SNCBQ16143 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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SNCBQ16143 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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SNCBQ16143 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SNCBQ16143 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
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