Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZIC1Q15915 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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