Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SNX17Q15036 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SNX17Q15036 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SNX17Q15036 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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