Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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LAPTM4AQ15012 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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LAPTM4AQ15012 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAPTM4AQ15012 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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