Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
DSC3Q14574 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DSC3Q14574 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DSC3Q14574 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
DSC3Q14574 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
DSC3Q14574 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
DSC3Q14574 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
DSC3Q14574 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
DSC3Q14574 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
DSC3Q14574 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DSC3Q14574 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms