Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM25Q14258 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
TRIM25Q14258 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM25Q14258 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM25Q14258 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM25Q14258 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM25Q14258 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM25Q14258 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM25Q14258 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms