Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EXOSC2Q13868 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
EXOSC2Q13868 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.3 ms