Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PKD2Q13563 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PKD2Q13563 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms