Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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TOP3AQ13472 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TOP3AQ13472 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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