Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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GPS1Q13098 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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GPS1Q13098 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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GPS1Q13098 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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GPS1Q13098 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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GPS1Q13098 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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GPS1Q13098 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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GPS1Q13098 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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GPS1Q13098 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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GPS1Q13098 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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GPS1Q13098 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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GPS1Q13098 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPS1Q13098 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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