Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ECH1Q13011 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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