Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NUP160Q12769 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NUP160Q12769 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NUP160Q12769 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NUP160Q12769 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NUP160Q12769 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
NUP160Q12769 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
NUP160Q12769 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NUP160Q12769 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NUP160Q12769 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NUP160Q12769 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NUP160Q12769 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NUP160Q12769 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NUP160Q12769 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms