Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CRXO43186 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CRXO43186 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.1 ms