Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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KRTAP9-3Q9BYQ3 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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