Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC6Q16204 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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