Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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