Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
APOFQ13790 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
APOFQ13790 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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APOFQ13790 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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APOFQ13790 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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APOFQ13790 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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APOFQ13790 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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APOFQ13790 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
APOFQ13790 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
APOFQ13790 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
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APOFQ13790 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
APOFQ13790 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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APOFQ13790 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
APOFQ13790 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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