Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160 ms