Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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