Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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