Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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