Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERVV-2B6SEH9 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms