Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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