Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CCDC142Q17RM4 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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