Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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CDO1Q16878 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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CDO1Q16878 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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CDO1Q16878 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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CDO1Q16878 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDO1Q16878 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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CDO1Q16878 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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CDO1Q16878 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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CDO1Q16878 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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