Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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RTN1Q16799 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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RTN1Q16799 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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RTN1Q16799 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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RTN1Q16799 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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RTN1Q16799 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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RTN1Q16799 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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RTN1Q16799 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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