Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
FXNQ16595 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
FXNQ16595 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
FXNQ16595 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
FXNQ16595 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FXNQ16595 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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FXNQ16595 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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FXNQ16595 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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FXNQ16595 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FXNQ16595 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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