Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms