Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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NKX1-1Q15270 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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NKX1-1Q15270 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NKX1-1Q15270 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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