Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAPTM4AQ15012 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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