Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ODF1Q14990 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms