Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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NFIXQ14938 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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NFIXQ14938 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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NFIXQ14938 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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NFIXQ14938 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NFIXQ14938 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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