Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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