Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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