Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PPFIA1Q13136 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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