Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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