Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTPREP23469 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTPREP23469 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPREP23469 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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