Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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