Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERGIC2Q96RQ1 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms