Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
FOXD1Q16676 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms