Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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